Unterschied zwischen Stapelgel und Trenngel

Hauptunterschied - Stacking Gel vs. Separation Gel

Die Begriffe Stapelgel und Trenngel werden zur Erläuterung der SDS-PAGE-Technik verwendet. SDS-PAGE oder Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamid-Gelelektrophorese ist eine Labortechnik, mit der Proteinmoleküle nach ihrem Molekulargewicht getrennt werden. Die Theorie hinter der Technik ist, dass Proteine mit unterschiedlichen Molekulargewichten unterschiedliche Migrationsraten zeigen; Moleküle mit niedrigem Molekulargewicht wandern schneller, während Moleküle mit hohem Molekulargewicht langsam wandern. Das Medium für die Migration ist ein Gel. Es gibt zwei Arten von Gelen, die als Stapelgel und Trenngel bezeichnet werden. Das Hauptunterschied zwischen Stapelgel und Trenngel ist das der pH-Wert des Stapelgels beträgt 6,8, während der pH-Wert des Trenngels 8,8 beträgt.

INHALT

1. Übersicht und Schlüsseldifferenz
2. Was ist Stacking-Gel?
3. Was ist Trenngel?
4. Beziehung zwischen Stapelgel und Trenngel
5. Side-by-Side-Vergleich - Stapelgel gegen Trenngel in Tabellenform
6. Zusammenfassung

Was ist Stacking-Gel??

Stapelgel ist ein niedrigkonzentriertes Polyacrylamidgel, das in der SDS-PAGE-Technik auf ein konzentrierteres Trenngel (Trenngel) aufgebracht wird. Das Stapelgel wird verwendet, um die Auflösung der Elektrophorese zu verbessern. Die Auflösung steigt aufgrund des Unterschieds zwischen den Konzentrationen des Stapelgels und des Auflösungsgels, die sich auf die Proteine in der Probe auswirken. Da die Konzentration an Polyacrylamid im Stapelgel gering ist, ist die Porengröße höher. Dies hilft auch bei der Erhöhung der Trennung.

Das Stapelgel ist ein lockeres Polyacrylamidgel mit großen Poren von etwa 7% Polyacrylamid. Diese Poren wirken nicht als wesentliche Barriere für große Proteinmoleküle. Daher beeinflusst dieses Gel die Mobilität dieser Proteine leicht. Dies macht eine Trennung nach Mobilität und Größe des Proteins durch Konzentrieren zwischen zwei Gelen.

Abbildung 01: SDS-PAGE Acrylamid Gel

Der pH-Wert des Stapelgels beträgt 6,8. Sein pH-Wert ist sauer als derjenige des Gels in 2 pH-Einheiten. Dieser pH-Wert impliziert eine geringere Ionenstärke und damit einen höheren elektrischen Widerstand. Dies bewirkt die Mobilität von Proteinen als andere im Gel vorhandene geladene Teilchen.

Was ist Trenngel??

Trenngel oder Trenngel einer SDS-PAGE-Technik ist ein hochkonzentriertes Polyacrylamidgel, das auf einem niedrig konzentrierten Stapelgel angeordnet wird. Das Trenngel enthält einen hohen Anteil an Polyacrylamid (10%). Der pH-Wert dieses Gels wird bei pH = 8,8 gehalten, was einen höheren pH-Wert als das Stapelgel darstellt.

Abbildung 02: Ein Gelelektrophoresegerät

Wenn die Proteinmoleküle das Trenngel erreichen, wird die Migration dieser Moleküle verlangsamt, da das Trenngel ein hochkonzentriertes Gel mit einer kleinen Porengröße ist, das als beträchtliche Barriere für die Bewegung der Proteinmoleküle wirken kann. Durch diese Verlangsamung können die anderen Proteine langsam migrieren, um aufzuholen, was zu einer engen, konzentrierten Bande zwischen den beiden Gelen führt.

Was ist die Beziehung zwischen Stacking-Gel und Trenngel?

Sowohl Stacking-Gel- als auch Separiergel-Typen werden in derselben Apparatur verwendet.

Was ist der Unterschied zwischen Stapelgel und Trenngel?

Stapelgel gegen Trenngel
Stapelgel ist ein niedrigkonzentriertes Polyacrylamidgel, das in der SDS-PAGE-Technik auf ein konzentrierteres Trenngel (Trenngel) aufgebracht wird.	Trenngel oder Trenngel einer SDS-PAGE-Technik ist ein hochkonzentriertes Polyacrylamidgel, das auf einem niedrig konzentrierten Stapelgel angeordnet wird.
Platzierung
Stapelgel wird auf das Trenngel gelegt.	Trenngel wird auf den Boden des für die Gelelektrophorese verwendeten Behälters gegeben.
Konzentration
Die Konzentration des Stapelgels ist hoch.	Die Konzentration an Trenngel ist gering.
Polyacrylamid-Gehalt
Stapelgel enthält etwa 7% Polyacrylamid.	Trenngel enthält etwa 10% Polyacrylamid.
pH-Wert
Der pH-Wert des Stapelgels beträgt 6,8.	Der pH-Wert des Trenngels beträgt 8,8.
Porengröße
Im Stapelgel sind große Porengrößen vorhanden.	Im Trenngel sind kleine Porengrößen vorhanden.
Auflösung
Durch das Stapeln von Gel wird eine bessere Auflösung erzielt.	Trenngel ergibt eine schlechte Auflösung.

Zusammenfassung - Stapelgel gegen Trennung Gel

Stapelgel und Trenngel sind zwei Arten von Polyacrylamidgelen, die zur besseren Trennung von Proteinmolekülen in einer gegebenen Probe verwendet werden. Der Unterschied zwischen Stapelgel und Trenngel besteht darin, dass der pH-Wert des Stapelgels 6,8 beträgt, während der pH-Wert des Trenngels 8,8 beträgt.

Referenz:

1. "Polyacrylamid-Gelelektrophorese". Polyacrylamid-Gelelektrophorese (Theorie): Molekularbiologisches Virtuelles Labor II: Biotechnologie und Biomedizinische Technik: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Hier verfügbar
2. „Wie SDS-PAGE funktioniert.“ Bitesize Bio, 16. Februar 2018. Hier verfügbar
3. "SDS-PAGE-Stapelgel - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)". Google Sites. Hier verfügbar

Bildhöflichkeit:

1.'SDS-PAGE Acrylamid gel'By Bensaccount in der Wikipedia auf Englisch, (CC BY 3.0) über Commons Wikimedia
2. "Gelelektrophorese-Apparat" Von Jeffrey M. Vinocur - Eigene Arbeit, (CC-BY 2.5) über Commons Wikimedia

Biochemie