Unterschied zwischen Cosmid und Phagemid

Das Hauptunterschied zwischen Cosmid und Phagemid ist die Art der Sequenzen, die es enthält. Ein Cosmid enthält eine cos-Stelle und ein Plasmid. Daher ist es ein Hybridvektor, während ein Phagemid ein Plasmid ist, das einen F1-Replikationsursprung des F1-Phagen enthält.

Cosmide und Phagemide werden zu Klonierungszwecken verwendet, insbesondere zum Klonieren größerer DNA-Fragmente. Diese werden vor allem beim Klonieren von Genen verwendet, die für die Produktion verschiedener Proteine ​​verantwortlich sind. Cosmide und Phagemide werden entweder alleine als Plasmide repliziert oder in Viruspartikel verpackt und anschließend repliziert.

INHALT

1. Übersicht und Schlüsseldifferenz
2. Was ist ein Cosmid?
3. Was ist ein Phagemid?
4. Ähnlichkeiten zwischen Cosmid und Phagemid
5. Side-by-Side-Vergleich - Cosmid und Phagemid in Tabellenform
6. Zusammenfassung

Was ist ein Cosmid??

Ein Cosmid, als Hybridplasmid bezeichnet, umfasst cos-Stellen, die aus Lambda-Phagenpartikeln und einem Plasmid extrahiert wurden. Diese cos-Stellen sind lange DNA-Fragmente mit 200 Basenpaaren. Daher haben sie kohäsive oder klebrige Enden, die es dem Plasmid erlauben, in die virale DNA zu passen. Daher sind die cos-Stellen für die Verpackung der DNA von entscheidender Bedeutung.

Es gibt drei Cos-Sites;

• cosN-Stelle - beteiligt am Nicken des DNA-Strangs durch Terminaseaktivität
• cosB-Site - beschäftigt mit dem Halten der Terminase.
• cosQ-Stelle - beteiligt an der Verhinderung des Abbaus der DNA durch DNasen.

Abbildung 01: Cosmid

Außerdem können Cosmids entweder einsträngige DNA oder doppelsträngige DNA unter Verwendung eines geeigneten Replikationsursprungs replizieren. Cosmide enthalten normalerweise Antibiotika-Resistenzgene als Marker für die Auswahl von Transformanten. Somit kann die Verwendung eines Cosmids als Vektor die Klonierung erleichtern, und der Restriktionsenzymverdau des Vektors kann dann diese Fragmente extrahieren.

Was ist ein Phagemid (Phasmid)?

Phagemid, auch als bezeichnet Phasmid, ist auch eine Art Hybridvektor. Phagemid enthält einen speziellen Replikationsursprung, der als f1-Replikationsursprung bezeichnet wird. Der f1-Replikationsursprung wird aus einem f1-Phagen extrahiert.

Phagemid kann sowohl einzelsträngige als auch doppelsträngige DNA replizieren. Die Replikation kann entweder als Plasmid stattfinden, während eine unabhängige Replikation durchgeführt wird, oder sie kann in Phagenpartikel verpackt werden und schließlich den bakteriellen Wirt infizieren E coli. Beim Anstecken der E coli Zellen benötigt der f1-Phage die Anwesenheit eines Pilus. Daher sind die Sexualbewegungen während des in vitro Verpackung von Phagemiden.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Cosmid und Phagemid??

• Sowohl Cosmid als auch Phagemid sind Klonierungsvektoren, die in der rekombinanten DNA-Technologie verwendet werden.
• Cosmid und Phagemid können einzelsträngige und doppelsträngige DNA replizieren.
• Beide können sich ähnlich wie Plasmide einer unabhängigen Replikation unterziehen.
• Cosmid und Phagemid können sich unterziehen in vitro Verpackung und infizieren Bakterienzellen.
• Sowohl Cosmid als auch Phagemid benötigen einen geeigneten Replikationsursprung zum Klonen.

Was ist der Unterschied zwischen Cosmid und Phagemid??

Cosmid gegen Phagemid
Cosmid ist ein Hybridvektor, der eine cos-Stelle und ein Plasmid enthält.	Phagemid ist ein Plasmid, das einen F1-Replikationsursprung des F1-Phagen enthält.
Präsenz von Cos Sites
Cos-Zentren sind in Cosmid vorhanden und für das In-vitro-Verpacken erforderlich.	Cos-Sites fehlen in Phagemid.
Vorhandensein von F1-Replikationsursprung
Im Cosmid kann der Replikationsursprung möglicherweise vorhanden sein oder nicht.	F1-Replikationsursprung ist in Phagemid vorhanden.
Vorhandensein antibiotikaresistenter Gene
Antibiotika-resistente Gene sind in Cosmiden vorhanden, um die Transformanten von Nicht-Transformanten zu identifizieren.	Antibiotika-resistente Gene sind in Phagemiden nicht vorhanden.
Anforderung an In-Vitro-Verpackungen
Benötigt eine Cos-Site.	Benötigt einen Sex-Pilus.

Zusammenfassung - Cosmid vs Phagemid

Cosmid und Phagemid sind Klonierungsvektoren, die in der rekombinanten DNA-Technologie verwendet werden. Cosmids sind Hybridvektoren, die spezielle klebrige Enden enthalten, die als Cos-Stellen bezeichnet werden. in-vitro Verpackungen erfordern diese cos-Standorte. Während Phagemide Plasmide sind, die einen aus f1-Phagen extrahierten f1-Replikationsursprung enthalten. Sowohl Cosmid als auch Phagemid können unabhängig voneinander repliziert werden in vitro Verpackung zu Bakterienzellen. Dies sind die wichtigen Unterschiede zwischen Cosmid und Phagemid.

Referenz:

1. Qi, H. et al. "Phagemid-Vektoren für Phagendisplay: Eigenschaften, Eigenschaften und Konstruktion." Journal of Molecular Biology., US-amerikanische Nationalbibliothek für Medizin, 30. März 2012. Hier verfügbar 
2.Collins, J und B Hohn. "Cosmids: Eine Art von Plasmid-Gen-Klonierungsvektor, der in vitro in Bacteriophage-Lambda-Köpfen verpackbar ist." Verfahren der National Academy of Sciences der Vereinigten Staaten von Amerika, US National Library of Medicine, Sept. 1978. Hier verfügbar  

Bildhöflichkeit:

1.'Cosmid (englisch) 'By Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia